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甘肃中医学院于 1978 年经国务院批准正式成立，是甘肃省唯一的省属医学类本科院校，拥有于己百、周信有、李少波、张士卿、王道坤、宋贵杰等全国知名专家，已为社会培养输送了近 20,000 名中医药高级专业人才。学院现有 14 个本科专业，涵盖了医学、理学、工学、管理学、经济学等 5 个学科门类； 1990 年被确定为硕士学位授权单位，现有中医学、中药学、中西医结合和临床医学 4 个硕士学位授权一级学科和临床医学、中药学 2 个专业学位培养点，同时具有同等学力人员申请硕士学位、高等学校教师在职攻读硕士学位、推荐优秀本科毕业生免试攻读硕士学位资格等。 2002 年起与南京中医药大学等兄弟院校联合培养博士研究生，现为 2008 ～ 2015 年博士学位授予单位立项建设单位，已形成了以本科生教育为主体，研究生教育为延伸，继续教育、留学生教育为补充的办学格局。
学院现有 10 个教学系部， 2 个二级学院， 3 个教学辅助部门，4个科研机构。有直属附属医院 2 所，非直属附属医院 4 所，教学医院 43 所，实习医院 9 所，实习药厂 13 个，药用植物野外实习基地 2 个，药材加工及鉴定实习基地 1 个，药材种植基地 1 个，其他专业实习基地 8 个。中国医学史馆、中药标本馆、敦煌医学馆荣获国家教学成果二等奖，省级教学成果一等奖，并与人体标本馆被国家科技部、中宣部、教育部、中国科协确定为全国青少年科技教育基地。
在科研方面，学院坚持以甘肃道地药材、地方中医药文献、西部常见病和疑难病的中医药防治、名老中医经验传承等研究为重点，现有 5 个国家中医药管理局重点学科、 2 个省级重点学科、 9 个 甘肃省医疗卫生重点学科、 9 个院级重点学科 ；拥有省内领先，总面积约 2200 平方米 的科研实验中心，并联合组建了“甘肃省中药现代化工程技术研究中心”、“兰州中药现代化工程技术研究开发中心”；有 甘肃省重点实验室（培育基地）“中药药理与毒理学重点实验室” 1 个，甘肃省高校省级重点实验室“中（藏）药化学与质量研究省级重点实验室” 1 个，甘肃省高校重点人文社科研究基地“敦煌文献整理与研究中心” 1 个，院级重点实验室 9 个。 主办《甘肃中医学院学报》、《中医儿科杂志》和《甘肃基层卫生》三种学术期刊。此外，学院已与美、英、日、韩等国以及港、澳、台地区建立了广泛的学术联系。
建院三十余年来，学院始终以打造甘肃中医药人才高地，办人民群众满意的高等中医药教育为己任，坚持以提高育人质量为根本，以学科建设为龙头，以队伍建设为关键，以科研开发和医疗服务为支撑，以科学管理为保障，坚持立足甘肃，面向全国，服务社会，西部一流的服务定位，为中医药事业和甘肃教育及医疗卫生事业的发展，为经济社会发展做出了积极贡献。
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