南京农业大学前身可溯源至1902年三江师范学堂农业博物科和1914年金陵大学农学本科。1952年,全国高校院系调整,由金陵大学农学院和中央大学农学院以及浙江大学农学院部分系科合并成立南京农学院。1963年被确定为全国两所重点农业高校之一。1972年学校搬迁至扬州,与苏北农学院合并成立江苏农学院。1979年迁回南京,恢复南京农学院。1984年更名为南京农业大学。2000年由农业部独立建制划转教育部。
学校设有农学院、工学院、植物保护学院、资源与环境科学学院、园艺学院、动物科学技术学院(含渔业学院)、动物医学院、食品科学技术学院、经济管理学院、公共管理学院(含土地管理学院)、人文社会科学学院、生命科学学院、理学院、信息科学技术学院、外国语学院、国际教育学院等16个学院。设有60个本科专业、157个硕士学科专业、77个博士学科专业和13个博士后流动站。现有各类在校生32000余人,其中全日制本科生17000余人,研究生8000余人。现有教职员工2732人,其中:博士生导师300余人,中国工程院院士2名,国家及部级有突出贡献中青年专家37人,“长江学者”和“千人计划”等特聘教授4人,国家教学名师2人,获国家杰出青年科学基金9人、入选国家各类人才工程和人才计划75人。
学校建有“国家大学生文化素质教育基地”、“国家理科基础科学研究与教学人才培养基地”和“国家生命科学与技术人才培养基地”,是首批通过全国高校本科教学工作优秀评价的大学之一。学校2000年建立研究生院,设有作物学、农业资源利用、植物保护和兽医学等4个一级学科国家重点学科,蔬菜学、农业经济管理和土地资源管理等3个二级学科国家重点学科,及食品科学国家重点培育学科,有8个学科进入江苏高校优势学科建设工程。
学校建有作物遗传与种质创新国家重点实验室、国家肉品质量安全控制工程技术研究中心、国家大豆改良中心、国家信息农业工程技术中心和农业部综合性实验室等53个国家及部省级科研平台。“十一五”期间,学校科研经费近15亿元,获得国家及部省级科技成果奖91项,其中国家科技进步一等奖1项、二等奖5项。据ESI评估,南京农业大学的农业科学、动物与植物科学及环境生态三个学科群进入全世界前1%。 学校主动为经济社会发展和“三农”服务,创造了巨大的经济社会效益,多次被评为国家科教兴农先进单位。